期刊简介
本刊是由广西医科大学一附院主办，是中华医学会外科学会分会的外科学组的专业性期刊，杂志编辑委员会由全国著名的大肠肛门病外科专家组成。理论与实用并管，主要反映大肠肛门病外科临床领域在国内外取行的新进展、新技术、新方法，传递研究成果和理论知识。
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- 杂志名称：结直肠肛门外科杂志
- 主管单位：广西卫生厅
- 主办单位：广西医科大学
- 国际刊号：1674-0491
- 国内刊号：45-1343/R
- 出版周期：双月刊
期刊荣誉：中国学术期刊(光盘版)全文收录期刊期刊收录：上海图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏
SNHG11在结直肠癌中的表达及功能预测
粱思远；徐艳松；陆绍龙；凌通；于航；韦传毅；唐卫中
关键词：结直肠癌, TCGA, SNHG11, LncRNA
摘要：目的 探究SNHG11在结直肠癌中的表达与临床病理之间的关系,并预测SNHG11参与结直肠癌发生发展的机制.方法 从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)下载结直肠癌临床病理及基因表达谱信息.通过HGNC(HUGO gene nomenclature committee,HGNC)中长链非编码RNA(IncRNA)数据库选出差异表达的lncRNA分析,通过cBio Portal for Cancer Genomics 网站对差异基因进行表达量的变化,分析SNHG11在结直肠癌中的表达情况,并探讨SNHG11表达和临床病理学参数的相关性.采用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)方法预测SNHG 11可能参与的代谢通路.结果 SNHG11的表达水平与结直肠癌T分期(P=0.028)、淋巴结转移(P=0.005)、远处转移(P=0.000)及TNM分期(P=0.001)显著相关.SNHG11高表达癌症样本显著富集到RNA聚合酶、RNA降解、前体RNA剪切、嘧啶代谢等相关基因集.结论 SNHG11可能通过调RNA合成,前体RNA的剪切等过程,从而参与了结直肠癌的发生与发展.
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